透析中头疼的发生率为5%，大多数原因不明确，常见原因有：
1、失衡综合征
发生率为3.4%~20%，是在透析中后期或者结束后不久发生的与透析有关的以神经系统症状为主的综合征。充分合理诱导透析，是减少失衡综合征的重要措施。
2、高血压
在透析中因血压升高引起的头痛。其发生率不高，但原因不清楚，而且比较顽固，难以处理。舌下交替含服开博通、心痛定，对轻、中度高血压有效。对于难治性高血压可用硝普钠或酚妥拉明静点，也可以配合使用镇静药，如安定10毫克肌注。严重高血压，经处理血压不能下降，应中止透析，中止后血压逐渐恢复正常。
3、硬水综合征
是由于用硬水进行透析时出现的急性高钙血症或高镁血症。临床表现为严重头痛、恶心、呕吐、全身温热感、皮肤瘙痒及发红、呼吸困难、心前区压迫感，脉缓、轻度高血压，甚至惊厥。透析前常规做硬水试验，如出现症状，不应透析。如透析后出现，没有必要处理，因高钙血症在24~48小时内即可消退。
4、颅内出血
透析患者常合并高血压和脑动脉硬化，颅内出血的病例也相应增多，突然血压升高，过量使用抗凝剂或轻微外伤，都可能是出血的原因。多囊肾患者的脑血管意外，可能是由于脑动脉瘤破裂所致。处理方法，停止透析，给予鱼精蛋白，进行暂时性腹膜透析，控制严重的高血压。此外，硬膜下血肿、脑栓塞患者均可出现头痛，应注意鉴别。
5、溶血
透析中因透析液温度过高(40℃)、机器的透析液监控装置失灵及误输异型血等，均可引起急性溶血。临床表现为沿穿刺静脉疼痛不适、血压下降、头痛、腰痛、心前区痛、脑性抽搐、酱紫色尿等，应立即停止透析。溶血后透析器及管道内血液不要输回体内，应输新鲜血。注意纠正高血钾。
6、醋酸盐不耐受
对于不耐受醋酸盐的患者，可以改用碳酸氢钠透析液透析。
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